Préchauffer le four à 180 °C.
Couper les aubergines en deux dans la longueur et retirer les extrémités. Entailler la chair en quadrillage avec la pointe d'un couteau, sans percer la peau.
Dans une poêle chaude avec un filet d'huile d'olive, faire dorer les demi-aubergines côté chair à feu moyen jusqu'à coloration.
Pendant ce temps, préparer le glaçage : dans une petite casserole, mélanger le miso, le mirin, la sauce soja, le sucre roux et le jus de citron. Chauffer quelques minutes à feu moyen en mélangeant jusqu'à obtenir une sauce homogène.
Déposer les demi-aubergines côté chair vers le haut sur une plaque recouverte de papier cuisson, puis badigeonner généreusement de glaçage au miso.
Enfourner environ 25 minutes, jusqu'à ce que les aubergines soient bien caramélisées et fondantes (baisser à 165 °C en fin de cuisson si la coloration va trop vite).
Parsemer de ciboulette ciselée au moment de servir.